Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM38O00635 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms