Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF879B4DU55 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF879B4DU55 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF879B4DU55 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF879B4DU55 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF879B4DU55 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF879B4DU55 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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ZNF879B4DU55 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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ZNF879B4DU55 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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ZNF879B4DU55 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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ZNF879B4DU55 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF879B4DU55 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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