Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC27A6Q9Y2P4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms