Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMG5Q9UPR3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms