Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms