Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC7AQ9ULT0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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