Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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