Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGSF9Q9P2J2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGSF9Q9P2J2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms