Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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USP35Q9P2H5 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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USP35Q9P2H5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP35Q9P2H5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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