Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCDH10Q9P2E7 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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