Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4Q9P0V3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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SH3BP4Q9P0V3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SH3BP4Q9P0V3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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