Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4GALTQ9NPC4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms