Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CEP44Q9C0F1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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