Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SEMA4CQ9C0C4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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