Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NLRP1Q9C000 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NLRP1Q9C000 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms