Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms