Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
AKAP9Q99996 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms