Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYNGAP1Q96PV0 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms