Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACAP3Q96P50 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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