Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOBEC4Q8WW27 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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