Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CDKL3Q8IVW4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL3Q8IVW4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL3Q8IVW4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL3Q8IVW4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL3Q8IVW4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CDKL3Q8IVW4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms