Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms