Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUX4L9Q6RFH8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DUX4L9Q6RFH8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms