Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms