Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DUPD1Q68J44 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DUPD1Q68J44 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms