Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms