Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HP1BP3Q5SSJ5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms