Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KHDC3LQ587J8 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms