Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms