Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDCCQ504Y2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms