Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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