Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CHD9Q3L8U1 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHD9Q3L8U1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD9Q3L8U1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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