Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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RRN3P1Q2M238 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RRN3P1Q2M238 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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