Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms