Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TAF1AQ15573 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TAF1AQ15573 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TAF1AQ15573 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TAF1AQ15573 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TAF1AQ15573 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TAF1AQ15573 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TAF1AQ15573 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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