Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SIX1Q15475 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX1Q15475 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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