Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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SYCP1Q15431 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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