Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL4A6Q14031 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL4A6Q14031 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms