Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DDX39BQ13838 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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