Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
APOFQ13790 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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APOFQ13790 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
APOFQ13790 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
APOFQ13790 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
APOFQ13790 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
APOFQ13790 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
APOFQ13790 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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