Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SYCNQ0VAF6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms