Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFFO1Q0D2I5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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