Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PIGFQ07326 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PIGFQ07326 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms