Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms