Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms