Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUCB1Q02818 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms