Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITX1P78337 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX1P78337 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX1P78337 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX1P78337 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITX1P78337 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITX1P78337 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms