Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERVFC1P60507 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms