Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms