Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB3P54753 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms